《名侦探柯南：贝克街的亡灵》是根据日本漫画家青山刚昌创作的漫画《名侦探柯南》改编的系列动画电影的第6部作品。影片讲述了少年侦探柯南挑战虚拟体感游戏过程中追寻解开杀人事件真相的线索并活跃行动的故事。

该影片曾位列名侦探柯南剧场版历代19部作品人气投票最终结果第2位。

东京·米花市·米花市政大楼。这里正在举行，能够一举改变全世界游戏业界价值观的模拟游戏“茧”的发表会。结合最先进技术的“茧”，其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过电脑操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过事件的年代，并进行挑战的虚拟体验游戏。

柯南、灰原及少年侦探队成员们也接获邀请，前往参加这场受到全世界瞩目的发表会，并阴错阳差的混入政界、财经界以及演艺界等代表人物的小孩群中，趁机乘上“茧”。另一方面，“茧”的研发者兼负责人－坚村，竟然在发表会会场遭到杀害，而在这起杀人事件发生的同时，一个自称“诺亚方舟”的人工智慧闯入“茧”的电脑系统，并切断身处虚拟世界的 50 名孩童所有能与外界连结的管道，对现实世界中所有招待者宣布：“在这场解决历史事件的游戏中，只要有一个人能够存活到最后就算你们赢。不过如果没有人能够存活到最后，参加游戏的所有人就会葬命于此。”开始了一场失控的游戏。

少数知道柯南身份，同时也是工藤新一的父亲，世界名推理作家——工藤优作也是这场发表会的特别来宾。优作负责监修“茧”游戏中的历史事件，虽然能透过推理找出坚村遭到杀害的原因，但关于柯南一行人安危，他也只能在控制室看著他们的表现。

柯南一行人必须在“茧”所设定重现的19世纪伦敦贝克街，同时也是夏洛克·福尔摩斯留下无数传说之地，挑战一连串的考验。一场结合虚拟实境与现实，用50条孩子的生命为赌注的游戏即将开始。